rna数据库都有哪些，tRNAdb 是什么生物信息数据库

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1，tRNAdb 是什么生物信息数据库
2，nosql数据库有哪些
3，小鼠circrna数据库齐全吗

1，tRNAdb 是什么生物信息数据库

ncRNA(non-coding RNA) 就是非编码RNA ，如小分子核仁RNA(sonRNA)、小RNA(miRNA)、小干扰RNA(siRNA)。NcRNA应该是遗传信息的携带者，RNA的一种,目前主要有三大种tRNA｜转运RNA，翻译｜mRNA信使RNA，转录｜｜rRNA核糖体RNA构成核糖体

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tRNAdb 是什么生物信息数据库

2，nosql数据库有哪些

NoSQL(NoSQL = Not Only SQL )，意即“不仅仅是SQL”，是一项全新的数据库革命性运动，早期就有人提出，发展至2009年趋势越发高涨。NoSQL的拥护者们提倡运用非关系型的数据存储，相对于铺天盖地的关系型数据库运用，这一概念无疑是一种全新的思维的注入。随着大数据的不断发展，非关系型的数据库现在成了一个极其热门的新领域，非关系数据库产品的发展非常迅速。现今的计算机体系结构在数据存储方面要有庞大的水平扩展性，而NoSQL也正是致力于改变这一现状。目前Google的 BigTable和Amazon 的Dynamo使用的就是NoSQL型数据库，本文介绍了10种出色的NoSQL数据库。虽然NoSQL流行语火起来才短短一年的时间，但是不可否认，现在已经开始了第二代运动。尽管早期的堆栈代码只能算是一种实验，然而现在的系统已经更加的e799bee5baa6e997aee7ad94e58685e5aeb931333337386632成熟、稳定。不过现在也面临着一个严酷的事实：技术越来越成熟——以至于原来很好的NoSQL数据存储不得不进行重写，也有少数人认为这就是所谓的2.0版本。这里列出一些比较知名的NoSQL工具，可以为大数据建立快速、可扩展的存储库。给一个地址吧http://www.caecp.cn/News/News-850.html

nosql太火，冒出太多产品了，保守估计也成百上千了。互联网公司常用的基本集中在以下几种，每种只举一个比较常见或者应用比较成功的例子吧。1. in-memory kv store : redisin memory key-value store，同时提供了更加丰富的数据结构和运算的能力，成功用法是替代memcached，通过checkpoint和commit log提供了快速的宕机恢复，同时支持replication提供读可扩展和高可用。2. disk-based kv store: leveldb真正基于磁盘的key-value storage, 模型单一简单，数据量不受限于内存大小，数据落盘高可靠，google的几位大神出品的精品，lsm模型天然写优化，顺序写盘的方式对于新硬件ssd再适合不过了，不足是仅提供了一个库，需要自己封装server端。3. document store: mongodb分布式nosql，具备了区别mysql的最大亮点：可扩展性。mongodb 最新引人的莫过于提供了sql接口，是目前nosql里最像mysql的，只是没有acid的特性，发展很快，支持了索引等特性，上手容易，对于数据量远超内存限制的场景来说，还需要慎重。4. column table store: hbase这个富二代似乎不用赘述了，最大的优势是开源，对于普通的scan和基于行的get等基本查询，性能完全不是问题，只是只提供裸的api,易用性上是短板，可扩展性方面是最强的，其次坐上了hadoop的快车，社区发展很快，各种基于其上的开源产品不少，来解决诸如join、聚集运算等复杂查询。

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3，小鼠circrna数据库齐全吗

1、starBase 一个高通量实验数据CLIP-Seq（或称为HITS-CLIP,PAR-CLIP,iCLIP）和mRNA降解组测序数据支持的microRNA靶标数据库,包含了miRNA-mRNA，miRNA-lncRNA，miRNA-circRNA，miRNA-ceRNA 和RNA-protein等的调控关系。整合和构建多个流行的靶标。

随着对circrna研究的越来越多，已知的circrna数据信息在快速增长，在这里我们肽度时界（timedoo）整理了当前circrna相关的数据库列表，希望能帮到您：1.circbase[1]，是一个通过收集和整合已经发布的circrna数据构建的数据库。目前该数据库收集包括以下6个物种的circrna信息：人 (hg19)、小鼠(mm9) 、秀丽线虫(ce6)、黑腹果蝇 (dm3)、矛尾鱼 (latcha1)、腔棘鱼 (latcha1)。该数据库最新版本发布时间为2014年1月。网址：http://www.circbase.org/。通过在搜索界面中的list search提交circbase支持的circrna id号或基因组区域位置信息，可以快速查询相关circrna信息；研究者也可以通过tablebrowser进行条件设置，筛选自己所需要的circrna数据。2.circrnabase[2] , 该数据库通过整合已发表的circrna数据，构建mirna与circrna以及circrna与rna结合蛋白（rbp)的互作网络。最新版本发布时间：2013年12月。网址：http://starbase.sysu.edu.cn/mircircrna.php3.circ2traits[3] ，是一个收集与人类疾病或性状潜在关联的circrna数据库。该数据库通过预测mirnas和人类的蛋白质编码基因、长链非编码基因及环状rna间的相互作用关系，构建了相互作用网络,　并对mirnas-circrna相互作用组中的蛋白编码基因进行了go富集分析；此外，将与疾病相关的snps位点定位到circrna基因座上，并鉴定了环状rnas上的ago相互作用位点。最新版本发布时间：2013年12月。网址：http://gyanxet-beta.com/circdb/4.circnet[4]，利用464个rna-seq测序数据，进行新circrna预测及基因组注释，并计算已知的及新预测的circrna表达情况，构建circrna-mirna-genet调控网络，以上信息均可从该数据库获得。版本发布时间：2015年12月。网址：http://circnet.mbc.nctu.edu.tw/5.deepbase v2.0[5]平台, 该数据平台收集了大约15万多的circrna基因（人、鼠、果蝇、线虫等），并构建了最全面的circrna的表达图谱。最新版本发布时间：2015年10月网址：http://deepbase.sysu.edu.cn/6.circinteractome[6]该数据库预测了已知的109个rna结合蛋白数据集与circbase中的circrna的结合位点，并利用targetscan软件预测了mirnas与circrna的潜在结合位点。最新版本发布时间：2015年12月网址：http://circinteractome.nia.nih.gov/你也可以上肽度时界（timedoo）查看circrna（环状rna）学术解读资料。

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