疾病靶点基因在哪个数据库找，在Pubmed里面怎么查疾病相关的基因位点

来源：整理时间：2024-03-18 23:39:06 编辑：黑码技术手机版

本文目录一览

1，在Pubmed里面怎么查疾病相关的基因位点
2，NCBI 网页上gene和genomic检索的区别是什么怎么找到一个疾病的
3，知道一个miRNA怎么找它的靶基因
4，求助一些找药物靶点对应的基因突变的网站或方法
5，哪个数据库能找到已经被验证的与特定疾病有关的mirna

1，在Pubmed里面怎么查疾病相关的基因位点

在NCBI的OMIM数据库查

在Pubmed里面怎么查疾病相关的基因位点

2，NCBI 网页上gene和genomic检索的区别是什么怎么找到一个疾病的

试一下OMIM——人类遗传疾病数据库

NCBI 网页上gene和genomic检索的区别是什么怎么找到一个疾病的

3，知道一个miRNA怎么找它的靶基因

让我来告诉你答案!可以去miRFocus上去看看，预测靶基因，信号通路的分析都有，并且是整合了多个在线工具的结果

知道一个miRNA怎么找它的靶基因

4，求助一些找药物靶点对应的基因突变的网站或方法

关注佳学基因公共号就可以的

佳学基因的药物研发和使用的专家很多，而且都是国际知名专家，不仅提供肿瘤化疗药物用药指导、也提供靶向药物用药、常见病、复杂疾病精准用药基因检测。

5，哪个数据库能找到已经被验证的与特定疾病有关的mirna

这里有一个软件：miRTarBae，不错！它整合实验证实的miRNA靶标的数据库。输入感兴趣的miRNA，即可找到验证了的靶基因。靶基因在Wikipedia就可找到它的功能！目前自己的实验验证了10个miRNA,找到一个有意思的miR483,它在小鼠上靶基因是SOCS3（Suppressor of cytokine signaling 3）

1、starbase一个高通量实验数据clip-seq（或称为hits-clip,par-clip,iclip）和mrna降解组测序数据支持的microrna靶标数据库,包含了mirna-mrna，mirna-lncrna，mirna-circrna，mirna-cerna 和rna-protein等的调控关系。整合和构建多个流行的靶标预测软件的交集和调控关系。最新版本发布时间：2013年11月。2、mirbase众所周知的microrna基因注释数据库。目前mirbase只提供了microrna的靶标的预测软件的链接（如：pictar）。最新版本发布时间：2010年9月。3、chipbase整合clip-seq和chip-seq的数据探讨microrna的转录和转录后调控，构建转录因子->microrna->靶标的调控网络。最新版本发布时间：2012年11月。4、tarbase一个收集已被实验验证的microrna靶标数据库。最新版本发布时间：2009年1月。5、mirecords一个整合的microrna靶标数据库。整合多个靶标预测软件的调控关系。最新版本发布时间：2010年11月。6、targetscan基于靶mrna序列的进化保守等特征搜寻动物的microrna靶基因。是预测microrna靶标假阳性率较低的软件。而且是microrna领域大牛bartel实验室开发的。最新版本发布时间：2009年4月。7、pictar基于microrna或microrna靶标联合作用等特征开发的搜寻动物的microrna靶基因。假阳性率也较低。是microrna领域大牛rajewsky实验室开发的。最新版本发布时间：2007年3月。8、pita基于靶位点的可接性和自由能预测microrna的靶标。是著名的生物信息学家segal实验室开发的。最新版本发布时间：2008年8月。9、rna22基于序列特征预测microrna的结合位点。是几个流行的microrna靶标预测软件的其中一个。ibm公司的研究团队开发的。最新版本发布时间：2007年。10、miranda和microrna.org是著名的memorialsloan-kettering 癌症研究中心的研究人员开发的软件和数据库。miranda的最新版本又叫mirsvr。最新版本发布时间：2010年8月。11、microcosmembl-ebi的enright 实验室开发的microrna靶标数据库。最新版本发布时间：2010年8月。12、mirtarbase整合实验证实的microrna靶标的数据库。最新版本发布时间：2010年10月。13、mirgator v2.0整合microrna表达、靶标和疾病相关信息的数据库。最新版本发布时间：2010年11月。14、mirnamap动物的microrna基因及其靶标的数据库。最新版本发布时间：2008年1月。15、mirdb动物microrna靶标预测和功能注释数据库。最新版本发布时间：2010年8月。16、rnahybrid一个基于mirna-target配对自由能预测microrna的靶标。最新版本发布时间：2011年6月。17、mirgenmicrorna基因和microrna靶标数据库。最新版本发布时间：2007年1月。